設計大型企業網絡系統集成方案的關鍵因素包括：

1. 需求分析：深入了解企業的需求和目標，包括業務需求、安全需求、性能需求、擴展性需求等，以便在系統設計階段確定合適的集成方案。

2. 系統架構設計：確定合適的網絡拓撲結構、硬件設備和軟件平臺，包括核心交換機、路由器、防火墻等組件的選擇與配置。

3. 安全策略：制定全面的安全策略，包括網絡安全、數據安全、訪問控制等，確保系統在保護敏感信息的同時保持高效運行。

4. 技術標準：遵循行業標準和最佳實踐，確保系統集成方案的可靠性、可維護性和互操作性。

5. 業務集成：將企業各個部門的業務系統無縫集成，確保數據共享和協同工作的高效性。

6. 性能優化：針對企業特定的業務需求，對網絡系統進行性能優化和調整，以確保系統能夠滿足高負載和快速增長的需求。

7. 自動化管理：引入自動化管理工具和技術，實現對網絡設備、安全策略、性能監控等方面的自動化管理，提升效率和降低人工成本。

8. 可伸縮性：考慮企業未來發展需要，設計可伸縮的系統集成方案，確保系統能夠方便地擴展和升級。

9. 故障容錯：設計系統集成方案時應考慮故障容錯能力，采用冗余備份、容錯切換等技術，以確保系統在發生故障時能夠快速恢復。

10. 合規性：確保系統集成方案符合相關法規和法律法規的要求，避免可能的合規性風險。

以上是設計大型企業網絡系統集成方案的關鍵因素，涵蓋了整個系統集成的方方面面。